区别在于性质不一样
通常所说的全日制本科是指通过普通高考被录取的普通高校统招本科，也就是国家计划；自考本科虽然也是本科，但是，属于高等教育自学考试性质，不是国家计划。
从人才的选拔角度来说，统招学生是通过严格的高考（选拔性考试）录取的，自考毕业生是通过自学考试（水平性考试）认定具有高等教育知识结构的。
一般情况下，招聘条件在于用人单位自己，当然，也和各地的人事主管部门的政策扶持有关。
例如，重庆市政府就出台了一些不错的政策，保证获得真实自考毕业证书的毕业生在落户和就业上与普通高校毕业生享受同等的政策待遇。
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